Sidek meninggal dunia pada jam 2:30 pagi Isnin 17 Oktober 2005 di Hospital Tengku Ampuan Rahimah (HTAR), Klang, pada usia 69 kerana kegagalan buah pinggang, kencing manis, radang paru-paru dan tekanan darah tinggi. Jenazah Allahyarham dikebumikan di Tanah Perkuburan Islam Banting.[8]

Beliau meninggalkan seorang isteri Bangaton Rahman dan anak Misbun, Razif, Jalani, Rashid, Rahman, Sharizan dan perempuan Rusitah dan Zamaliah. Isterinya Datin Rukinah Sulaiman, meninggal dunia pada 29 Januari 2003 pada usia 61 tahun akibat angin ahmar.[11]